对鸡蛋或对疫苗中任一成分过敏者不宜接种流感疫苗。伴或不伴发热症状的轻中度急性疾病者，建议症状消退后再接种。上次接种流感疫苗后6周内出现格林巴利综合征者，不作为禁忌症，但应特别注意。
接种三价灭活流感疫苗是安全的，但注射部位一过性局部反应较常见（接种部位红晕、肿胀、硬结、疼痛、烧灼感等）；既往无流感疫苗抗原暴露史的受种者（如幼儿）可出现发热、全身不适、肌痛及其他全身性不良事件（如头痛、头晕、嗜睡、乏力、恶心、呕吐、腹痛、腹泻等），但程度均较轻微，极少出现重度反应。
接种完成后接种医生应告知接种对象留下观察30分钟再离开。回家后注意休息，注意观察接种后反应。接种医生应向接种对象公布接种点咨询电话，有任何不适随时咨询报告。为保障流感疫苗的安全接种，各级疾病预防控制机构和接种单位要做好流感疫苗疑似预防接种异常反应（adverseeventsfollowingimmunization，AEFI）监测。一旦出现不良反应或事件应及时启动AEFI监测系统，并按照《全国疑似预防接种异常反应监测方案》要求，开展AEFI的监测报告、调查诊断、处置等工作。
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